脂多糖活化巨噬细胞的数字基因表达谱分析

摘要：目的 研究巨噬细胞经脂多糖（LPS）处理后基因表达谱的变化。方法 LPS 0.01 mg·L-1作用RAW264.7细胞24 h，应用数字基因表达谱（DGE）技术筛选差异表达基因，分析差异基因富集的Gene ontology（GO）功能和Kyoto encyclopoedia of genes and genomes（KEGG）信号通路，并通过定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果 LPS处理后，共有1959个基因差异表达，其中上调974个，下调985个。GO分析显示，差异表达基因主要发挥蛋白结合和催化活性等分子功能，以及调节细胞过程、对环境刺激的反应和免疫系统等生物学功能。信号通路分析显示，显著富集的途径与炎症、免疫系统和癌症等疾病密切相关。结论 DGE技术验证了LPS介导炎症反应的NF-κB、丝裂原激活蛋白激酶和Jak-STAT 3条主要的信号转导途径，发现了细胞周期、细胞凋亡和细胞外识别等新的途径。